This email from srimenon@seas.upenn.edu originates from outside Imperial. Do not click on links and attachments unless you recognise the sender. If you trust the sender, add them to your safe senders list to disable email stamping for this address.

 

Hello all!
I'm new to Nektar and have been trying to solve for incompressible flow using the MPI parallelisation feature.

Problem: I run the command 'mpirun -np 4 $<path to solver>/IncNavierStokesSolver file.xml' and it does not work at all. No error no solver initialization.
On running the same command with one modification  'mpirun -np 4 \$<path to solver>/IncNavierStokesSolver file.xml' the following error is encountered:
--------------------------------------------------------------------------
mpirun was unable to launch the specified application as it could not access
or execute an executable:

Executable: \<path to solver>/IncNavierStokesSolver
Node:XYZ

while attempting to start process rank 0.
--------------------------------------------------------------------------
4 total processes failed to start

Background: I am certain the server I work on has MPI enabled on it. When configuring the nektar package I switch the NEKTAR_USE_MPI to ON, and leave everything else as is, then install the make. I am also certain the file I'm trying to solve parallely works serially. I am not even being able to parallely execute standard files like Cyl.xml in the Examples of IncNavierStokesSovler. Following is my ccmake configuration list for reference.

What am I doing wrong? Kindly advise. Thank you!

Regards,
Srihari Menon
University of Pennsylvania

Configuration list:

CMAKE_BUILD_TYPE                 Release                                                                                                                                                                  
 CMAKE_INSTALL_PREFIX             /home1/s/srimenon/nektar++-4.4.1/build/dist                                                                                                                              
 CONVERT                          /usr/bin/convert                                                                                                                                                        
 NEKTAR_BUILD_DEMOS               ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_BUILD_DOC                 OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_BUILD_LIBRARY             ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_BUILD_SOLVERS             ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_BUILD_TESTS               ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_BUILD_TIMINGS             OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_BUILD_UNIT_TESTS          ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_BUILD_UTILITIES           ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_ADR                ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_APE                ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_CARDIAC_EP         ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_COMPRESSIBLE_FLO   ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_DIFFUSION          ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_ELASTICITY         ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_INCNAVIERSTOKES    ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_PULSEWAVE          ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_SOLVER_SHALLOW_WATER      ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_TEST_ALL                  OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_TEST_FORCEMPIEXEC         OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_TEST_USE_HOSTFILE         OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_ACML                  OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_ARPACK                OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_BLAS_LAPACK           ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_CCM                   OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_FFTW                  OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_HDF5                  OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_MESHGEN               OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_MKL                   OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_MPI                   ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_OPENBLAS              ON                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_PETSC                 OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_SCOTCH                OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_SMV                   OFF                                                                                                                                                                      
 NEKTAR_USE_VTK                   OFF                                                                                                                                                                      
 THIRDPARTY_BUILD_BLAS_LAPACK     ON                                                                                                                                                                      
 THIRDPARTY_BUILD_BOOST           ON                                                                                                                                                                      
 THIRDPARTY_BUILD_GSMPI           ON                                                                                                                                                                      
 THIRDPARTY_BUILD_LOKI            ON